摘要:微型真核生物是水生生态系统的重要组成部分,具有极高的物种多样性,在生物地球化学循环中发挥关键作用。高通量测序技术的发展和应用有助于我们对微型真核生物的研究和认知。为了研究水体微型真核生物多样性和群落特征,我们可以从水体环境 (海洋、河流、湖泊、水库等) 中采集样品,提取样品总DNA进行文库构建及相关检测。首先以总DNA为模板,选择合适的标记基因 (主要是18S rRNA基因的片段) 进行PCR扩增,将PCR产物通过电泳、胶回收得到纯化的目的DNA片段,并测定DNA浓度,最后按照等质量方式进行混样,通常30份样品混为1个库,检测合格的文库采用高通量测序平台 (如Illumina HiSeq) 进行测序。
关键词: 微型真核生物, DNA条形码, 环境DNA, 建库方法, 高通量
材料与试剂
仪器设备
实验步骤
致谢
感谢国家自然科学基金(91851104)、福建省自然科学基金(2019J02016)、厦门市科技计划项目(3502Z20203077)的资助。
参考文献
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