高通量筛选实验手册
高通量筛选(High-throughput screening, HTS)是一项以药物研发为主要目标的现代化科学技术。作为发现新的靶标及活性分子的一种重要策略,高通量筛选是药物研发过程中非常重要的环节。它以化学、生物学、计算机科学等多学科的理论为基础,利用自动化系统控制实验的执行,具有快速、灵敏和精准的特点。通过高通量、自动化的筛选,研究人员可以获得大量的实验信息,高效地实现对活性化合物、抗体、基因等的表征和鉴定,从而更好地推进药物研究的发展。
根据实验模型的不同,高通量筛选方法可以大致分为两类:基于分子水平的筛选和基于细胞水平的筛选。分子水平的筛选可以检测酶或受体功能的改变、探针与蛋白质的结合,以及蛋白-配体结合的动力学特征等。该类筛选方法具有系统简单、作用直接、检测快速、操作便捷的特点。细胞水平的筛选则是利用完整的细胞,通过细胞活力检测、基因编辑、报告基因、高内涵成像等技术寻找潜在的药物作用靶点,发掘有潜力的活性分子。细胞水平的筛选方法具有可视化、动态、多参数综合评价等突出优势。
高通量筛选实验的关键是能否建立稳定的、通量化的筛选模型。稳定的筛选模型有利于提高实验效率和实验结果的准确性,能更有效地从大量筛选结果中获得有用的信息。模型的建立依赖于合理的实验设计、可靠的分析方法和质量控制。第1版《高通量筛选实验手册》立足于经典的生化水平与细胞水平的高通量筛选案例,总结科研人员在筛选中的研究思路以及方法运用中的经验和教训,同时交叉了组学和计算机辅助虚拟筛选等内容的精华,旨在为药学、生命科学、医学、化学生物学等领域的研究人员提供实验参考。本手册分为功能基因组筛选及药物筛选两大部分,细分为6个章节,共45个实验方法,实验方案均由活跃在一线的科研工作者和技术人员提供。我们希望在分享详实的实验模型和方案的同时,帮助科研人员实现实验数据可追溯,实验条件可再现,实验过程可重复,从而助力国内相关领域的研究。
我们衷心感谢来自20家单位的94位科研与实验技术一线的专家们,他们严谨的科研态度保障了本手册的品质;同时感谢Bio-protocol编校人员,他们严谨的工作作风使本手册的编辑工作得以顺利开展,希望本手册能为我国药物研发提供新的助力。随着生物技术的飞速发展,还将有更多先进的高通量筛选方法被开发和使用,我们后续还将持续择优收录各类普适性强的高通量筛选方法于本手册中,为研究人员提供更多的参考信息。
商世瑛,韩帅,兰姝珏
2022年1月