IP-Phosphorylation level Assay protocol
1. 取0.5g叶片,将其放入液氮预冷的研钵中,加入液氮研磨,致其成为细粉状,将粉末放入预冷的2ml离心管中,加入0.5ml lysis buffer.
2. 放入4度,360°摇床50min。
3. 13000rpm 4度15min 吸上清,重复一次。(取50ul作为input)
4. 预处理beads,每个样品加25ul beads,用lysis buffer(不含有cocktail,PMSF 但是添加Triton-100,DTT),500ul 2500g 4度2min。重复一次(注:把lysis buffer加入beads中先轻柔混匀,冰上静置1min 再离心,吸上清过程中不要吸出beads,适当留点液体。)
5. 将上清都加入预处理过的beads中,放入4度,360°摇床3h。
(注:孵育3h这段时间先跑input 作为Actin内参)
6. 离心,2500g 4度2min。
7. 丢弃上清,用lysis buffer(不含有cocktail,PMSF 但是添加Triton-100,DTT),500ul 2500g 4度2min,重复三次。最后一次尽量吸干净上清。
8. 加入50ul elution buffer,室温用手轻柔混匀5min,(若样品多,则分批次做,一次最好操作两个样品),离心2500g RT 2min。
9. 加入5ul平衡液,加入10ul 6XSDS(提前99度预热的)。37度孵育10min,点样。(后面按照Western Blot 进行操作)
10. 80V预电泳30min,后调成150V电泳。当目的条带电泳至分离胶中间时,停止电泳。用单蒸水轻轻清洗玻璃板,取出蛋白胶,切去浓缩胶,可以在分离胶的左上方切去一个小角以辨别方向。然后迅速置于1xTGM中。ATTENTION: 1 1x Running Buffer 至多使用两次。
2 若是奇数块胶,注意配平,夹紧。
11.转膜
1 依次向半干转系统叠放:厚的滤纸(Extra thick blot paper/Filter paper)→3mm滤纸→膜(Nitrocellulose Membranes)→蛋白胶→3mm滤纸→厚的滤纸,每放一层,倒上1xTGM(半干转200ml左右就足够,湿度转需要1.5L,4度保存) 浸湿(缓慢的将膜一点一点的放入,使膜完全浸湿)。叠放完后,用玻璃试管擀气泡,不能太用力。
ATTENTION: 1 厚的滤纸至多使用两次,第一次使用时转膜可以不加3mm滤纸,第二次使用时必须用3mm滤纸,厚滤纸使用一次后用单蒸水浸泡2-3次,再晾干后使用。
2 膜的大小为8.3cm x 5.6cm(差不多就是胶的大小)。
3 盖住仪器盖子时请注意对准方向。
4 电源为高压电泳系统。
5 蛋白分子质量 M<50KDa,24V,30min
M>50KDa,24V,30-40min(实践经验需要1h30min)
M.>100KDa,湿转 (24v,过夜)
12. 1染色脱色
转膜完成后,取出膜迅速置于旁素染液中,染色1min,回收Ponceau S染料。(Ponceau S,根据使用频率配制一定的量储存,每次使用2-3ml,用完后可回收,每次使用会有损失,带其快用完后再配新的)
用灭过菌的ddH2O漂洗两遍。拍照(染色这里染得蛋白,看你的转膜效率。拍照需要拍下来rubisco,内参,代老师实验室用的是actin的抗体,更准确相对来说)
用1x TBST(4度) 漂洗两遍。
2封闭
用1x TBST 配置5% nonfat milk(一张膜,10ml即可,用摇床摇匀脱脂牛奶再使用),室温,摇床,1h。
用1x TBST迅速漂洗一次。
3 一抗
用1x TBST 配置1% nonfat milk 10ml,加一抗2ul。4℃,摇床,16h,回收一抗。
ATTENTION: 1 一抗可以使用五次,注意回收。(有的实验室是封闭4度过夜,一抗室温几个小时,你可以自己查查区别)
4 二抗
用1x TBST漂洗,8min。重复一次。
用1x TBST 配置1% nonfat milk 10ml,加二抗1ul。室温,摇床,30min。(二抗不回收,羊抗兔,羊抗鼠根据一抗的来源确定)
用1x TBST漂洗,室温,摇床,8min。重复一次。
六 照膜
显色液配置,体积比Luminal/enhancer Solution:Peroxide Solution = 1:1
(8.3cm x 5.6cm 大小的膜需要1.2ml 显色液),蛋白膜需与此混合液充分接触。
IP Lysis buffer配方:
10% glycrerol
50Mm Tris-HCl(PH7.5)
150mM Nacl
0.5% Triton 100
2mM DTT
1 mM EDTA(PH8.0)
1Xcocktail PMSF
抗体:
一抗:Anti-GFP 1:5000 10ml TBST中加2ul(鼠抗)
Anti-P-Thr 1:1000 10ml TBST中加10ul(兔抗)
Anti-Actin 1:5000 10ml TBST中加2ul(鼠抗)
二抗:
Goat anti Mouse IgG :1:10000 10ml TBST中加1ul
Goat anti Rabbit IgG :1:10000 10ml TBST中加1ul